Laboratório de Biologia Molecular Estrutural
O LaBiME desenvolve pesquisas nas áreas de biofísica e bioquímica de macromoléculas, com foco em proteínas relacionadas a ocorrência de doenças neurodegenerativas. As proteínas mais estudadas pelo grupo são a proteína prion (PrP) e a α-sinucleína (α-Syn), que, quando mal enoveladas, estão respectivamente relacionadas às encefalopatias espongiformes e à Doença de Parkinson. A equipe do LaBiME busca identificar os mecanismos moleculares relacionados à mudança de conformação e agregação de proteínas tipo-prion, como a PrP e a α-Syn. Empregamos técnicas biofísicas e de biologia celular para avaliar a interação das proteínas alvo com ligantes fisiológicos e pequenos compostos orgânicos. No âmbito terapêutico, realizamos a seleção e caracterização de compostos moduladores de agregação proteica como candidatos a fármacos para doenças neurodegenerativas.
Projetos e parcerias
Projeto 1 - Abordagens terapêuticas para doenças neurodegenerativas
Projetos com foco nas encefalopatias espongiformes transmissíveis e na Doença de Parkinson
Equipe
Estrutura
Endereço
Sala 36, bloco B, subsolo
Centro de Ciências da Saúde
Av. Carlos Chagas Filho, 373
CEP: 21941-902
Estrutura
O LaBiME tem área total de 100 m2 e é equipado para o estudo biofísico de proteínas envolvidas em doenças causadas por agregação proteica, principalmente doenças neurodegenerativas.
Equipamentos: Cabine de segurança microbiológica, centrífuga refrigerada de bancada, equipamentos para eletroforese vertical e sistema de transferência para blot, colunas cromatográficas para purificação proteica, espalhamento de luz dinâmico DynaPro NanoStar (Wyatt), fluorímetro FP-8200 (Jasco), leitor de placas ClarioStar, calorímetro de titulação isotérmica ITC200 (Malvern), espectrofotômetro UV-VIS (Shimadzu), sistema de purificação Äkta Prime (Ge Helthcare), capela de exaustão de gases, sistema de purificação de água, estufa microbiológica.
Produções recentes
Gomes, M. P. B.; de Lima E. V.; Barros-Aragão, F. G. Q.; Passos, Yulli M.; Lemos, F. S.; Zamberlan, D. C.; Ribeiro, G.; Macedo, B.; Ferreira, N. C.; Silva, J. L.; Figueiredo, C. P.; Clarke, J. R.; Cordeiro, Yraima. Prion protein complexed to a DNA aptamer induce behavioral and synapse dysfunction in mice. BEHAVIOURAL BRAIN RESEARCH, 419, 113680, 2022.
Amaral, M. J.; Freire, M. H. O.; Almeida, M. S.; Pinheiro, A. S.; Cordeiro, Yraima. Phase separation of the mammalian prion protein: physiological and pathological perspectives. JOURNAL OF NEUROCHEMISTRY, 2022. In press.
Passos, Yulli M.; Do Amaral, M. J.; Do Carmo Ferreira, N.; Macedo, B.; Chaves, J. A. P.; De Oliveira, V. E.; Gomes, M. P. B.; Silva, J. L.; Cordeiro, Yraima. The interplay between a GC-rich oligonucleotide and copper ions on prion protein conformational and phase transitions. INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES, 173, 34-43, 2021.
Gonçalves, Priscila B.; Sodero, A. C. R.; Cordeiro, Yraima. Green Tea Epigallocatechin-3-gallate (EGCG) Targeting Protein Misfolding in Drug Discovery for Neurodegenerative Diseases. BIOMOLECULES, 11, 767, 2021.
Matos, C. O.; Passos, Y. M.; Amaral, M. J.; Macedo, B.; Tempone, M. H.; Bezerra, O. C. L.; Moreaes, M. O.; Almeida, M. S.; Weber, G.; Missailidis, S.; Silva, J. L.; Uversky, V. N.; Pinheiro, A. S.; Cordeiro, Yraima. Liquid-liquid phase separation and fibrillation of the prion protein modulated by a high-affinity DNA aptamer. FASEB JOURNAL, 34, 365-385, 2020.
Ascari, Lucas M.; Rocha, S. C.; Gonçalves, Priscila B.; Vieira, T. C. R. G.; Cordeiro, Yraima. Challenges and Advances in Antemortem Diagnosis of Human Transmissible Spongiform Encephalopathies. FRONTIERS IN BIOENGINEERING AND BIOTECHNOLOGY, 8, 585896, 2020.